Есть две доминирующие версии. Первая - что озеро было до появления антарктического оледенения, то есть его возраст порядка 30 млн лет. И с тех пор оно изолировано. Вторая что озеро образовалось уже во время развития ледника от его трения о поверхность, нагрева и таяния.
Стоит указать. Что Восток имеет чрезвычайно большую глубину. Фактически это что то типа Байкала. достоверно установленная глубина озера более 1050 метров. Озеро длинной, но узкое, характеризуется крутыми бортами и т.д. На схемах рисуют что оно развито вдоль параллельных глубинных разломов. Хотя более вероятно что и в тектоническом плане оно идентично таким объектам, как Байкал, Танганьика, Ньяса. Также следует отметить что урез воды в озере на разных участках неодинаков. Далее урез воды в озере ниже уровня мирового океана. Хотя есть сомнение, потому что там счет идет на десятки метров. Возможно что отдельные участки Востока и превышают уровень океана, а значит из него гипотетически возможен подледный сток.
Хотя я уже выдвигал версию (и не только я один) что Восток обязан своим происхождением наличию там нмогочисленных крупных термальных источников.